La secuenciación long-read y su aportación al TEA

 La secuenciación long-read (LR-WGS) está resolviendo uno de los problemas que existía en cuanto a la genética del autismo: el de la “heredabilidad perdida” o parte del riesgo genético no detectado por las tecnología tradicionales. 

Los métodos clásicos o short-read leen el ADN en fragmentos muy pequeños, lo que no permite detectar variantes complejas, repeticiones en tándem o mutaciones somáticas o de novo en regiones complejas. La tecnología LR permite leer segmentos mucho más largos, reconstruyendo regiones completas del genoma que quedaba “rotas” o mal interpretadas. 

Los estudios más recientes muestran que la secuenciación LR incrementa un 33% la detección de variantes estructurales que alteran genes y un 38% la detección de repeticiones. Esto significa que una parte importante de las mutaciones que contribuyen al TEA eran literalmente invisibles con las técnicas anteriores. La secuenciación LR ha permitido descubrir nuevas variantes exónicas de Novo, mutaciones en regiones complejas y reordenamiento que nunca se habían descrito, como eventos duplicacion-deleción anidados. También han permitido la mejor comprensión de regiones críticas como FMR1. El análisis conjunto de LG y metilaciones, que permiten silenciar genes, ha revelado cómo las expansiones intermedias de CGG (34 a 54 repeticiones) afectan a la metilación del promotor de FMR1.

Esta tecnología abre nuevas vías para entender fenotipos intermedios entre TEA, discapacidad intelectual y síndromes asociados. Los estudios estiman que las variantes detectadas gracias a LR-WGS explican entren el 6,2% y el 7,4% de la heredabilidad del TEA en las muestras analizadas. 

Pero, ¿qué podría implicar todo esto en cuanto al diagnóstico clínico? Muchos casos negativos en pruebas genéticas previas podrían volver a analizarse con LR-WGS y obtener una resultado positivo. Además, al identificar mecanismos antes invisibles, se abrirían nuevas líneas de investigación para nuevos tratamientos. 

Podríamos concluir la secuenciación LR es un cambio de paradigma que revela variantes que antes nos existían, permitiendo afinar en el diagnóstico de TEA. 

Para saber más:

Mortazavi, M., Guevara, J., Diaz, J., Tran, S., Ziaei Jam, H., Batalov, S., Bainbridge, M., Besterman, A. D., Gymrek, M., Palmer, A. A., & Sebat, J. (2026). Long-read genome sequencing improves detection and functional interpretation of structural and repeat variants in autism. Cell Genomics, 6(3), 101186

Memoria operativa y su relación con la evasión mental

 Resumiendo un poco, a mayor evasión mental, menor rendimiento en memoria operativa. La memoria operativa es la capacidad de mantener y manipular información de forma temporal. La evasión mental o tendencia a que la atención se desvíe a pensamientos no relacionados con la tarea consumiría recursos atencionales necesarios para la memoria operativa. En cuanto a los estilos de procesamiento, un estilo analítico se relaciona con un mejor rendimiento de la memoria operativa. Un estilo holístico muestra una relación más débil, incluso negativa, con tareas que requieren control ejecutivo.

Para saber más:

Alonso-Hoyas, M. Mar (2017). Memoria operativa y su relación con la evasión mental y el estilo de procesamiento. figshare.

El contagio del bostezo como indicador del desarrollo de la empatía

 Ya he posteado anteriormente el acceso a este artículo, pero os dejo una infografía que explica un poco de qué va el trabajo, de forma resumida. Se trata de un diseño cuasiexperimental para evaluar si el bostezo puede utilizarse como medida indirecta de contagio emocional y empatía. Es interesante destacar que las mujeres con TEA presentan mayor susceptibilidad al bostezo contagioso. 

Calidad de Vida en el Síndrome de Tourette

 Este póster resume la investigación que realicé sobre la calidad de vida de niños y adolescentes con síndrome de Tourette. Algunas conclusiones os resultarán interesantes…

Confusión de roles en la adolescencia

 Aquí os dejo otra infografía que he realizado sobre la confusión de roles en la adolescencia.

Oversharenting

 

Nueva investigación abre nuevas vías para el tratamiento de estereotipias

Las estereotipias nos sólo aparecen en los humanos, sino que son frecuentes en el reino animal. De hecho, se han visto en todas las especies de mamíferos y aves en cautividad.  Los comportamientos repetitivos anormales ó ARB en animales, dependen de la disfunción de la vía indirecta de comunicación entra la corteza y el cuerpo estriado de los ganglios basales, que es inhibidora. Esta disfunción está relacionada con un desequilibrio oxidación-reducción (REDOX), es decir, que la demanda fisiológica de antioxidantes supera su disponibilidad. Como la naturaleza de las vías de comunicación entre los ganglios basales y la corteza están muy conservadas a lo largo de la evolución, lo que quiere decir que no hay mucho cambio entre unas especies y otras, es muy posible que el desequilibrio REDOX sea la base de las estereotipias. De hecho, hay evidencia que implica que este desequilibrio REDOX aparece en varios trastornos del neurodesarrollo y neuropsiquiátricos. 

El departamento de Medicina Comparada de la Universidad de Stanford ha llevado a cabo un estudio en el que demuestran que los niveles de glutatión (GSH) en plasma predicen la gravedad de la estereotipia en ratones jóvenes, pero no así en ratones mayores. El GSH sería el biomarcador del desequilibrio REDOX; es un antioxidante que neutraliza los radicales libre. Cuando el GSH reacciona con los radicales libres, 2 moléculas de GSH se unen para formar GSSG. Altos niveles de GSGS indican que el sistema antioxidante de las células está sobrecargado y, entonces, se produce un estado de estrés oxidativo. Además, el metabolismo de la dopamina produce muchos radicales libres de oxígeno, neurotóxicos, que son neutralizados, como ya hemos visto, por el GSH. 

Ese estudio sugiere que podría determinarse si el nivel de GSH en plasma estaría también relacionado con la gravedad de la estereotipias en humanos (todo apunta a que sí). Y, más interesante aún, que la terapia con antioxidantes podría ser efectiva para tratar e incluso prevenir el desarrollo de las estereotipias. 

Para saber más:

Coden, K. M., Beacham, K. J., Stix-Brunell, B. E., Moorhead, R., Byrd, K. A., Baker, J. N., ... & Garner, J. P. (2025). Stereotypy is strongly linked to multiple biomarkers of oxidative stress—a potential common etiology for Abnormal Repetitive Behaviors. bioRxiv, 2025-06.